Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SDR16C6P-202ENST00000524136 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms