Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF8Q02556 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms