Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms