Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFITM3Q01628 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms