Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F1Q01094 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms