Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP1P63208 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms