Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK-21P61565 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVK-21P61565 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms