Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NME5P56597 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NME5P56597 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NME5P56597 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NME5P56597 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME5P56597 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME5P56597 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME5P56597 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME5P56597 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NME5P56597 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms