Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP6P55212 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP6P55212 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP6P55212 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP6P55212 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms