Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAD23AP54725 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAD23AP54725 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms