Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
THOP1P52888 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
THOP1P52888 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms