Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDGFP51858 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDGFP51858 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDGFP51858 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDGFP51858 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDGFP51858 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDGFP51858 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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