Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SMARCA2P51531 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMARCA2P51531 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms