Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CX3CR1P49238 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CX3CR1P49238 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CX3CR1P49238 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CX3CR1P49238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CX3CR1P49238 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms