Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UTRNP46939 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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