Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATRXP46100 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms