Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
XCR1P46094 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
XCR1P46094 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
XCR1P46094 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
XCR1P46094 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms