Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TSFMP43897 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TSFMP43897 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TSFMP43897 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TSFMP43897 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TSFMP43897 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms