Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms