Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN2P35609 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms