Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD12P35452 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms