Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms