Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRABP1P29762 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms