Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms