Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms