Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms