Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms