Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HRCP23327 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HRCP23327 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HRCP23327 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
HRCP23327 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HRCP23327 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HRCP23327 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms