Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGCP20142 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PGCP20142 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PGCP20142 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PGCP20142 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms