Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF3P18847 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF3P18847 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms