Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VCLP18206 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VCLP18206 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VCLP18206 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VCLP18206 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms