Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BRAFP15056 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms