Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GP1BBP13224 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms