Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD3P0DMS9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms