Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C8orf88P0DMB2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms