Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRCP08575 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRCP08575 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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