Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TPOP07202 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPOP07202 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPOP07202 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPOP07202 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TPOP07202 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TPOP07202 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TPOP07202 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TPOP07202 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms