Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms