Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYBBP04839 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYBBP04839 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms