Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DPB1P04440 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLA-DPB1P04440 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLA-DPB1P04440 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DPB1P04440 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms