Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS6KA4O75676 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms