Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SKAP2O75563 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKAP2O75563 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms