Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP4O75379 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP4O75379 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms