Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPFIA4O75335 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPFIA4O75335 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms