Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC9O60706 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms