Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA0556O60303 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIAA0556O60303 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms