Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLIN1O60240 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLIN1O60240 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms