Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCO2O43819 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCO2O43819 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCO2O43819 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCO2O43819 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms