Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN4O43707 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACTN4O43707 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms