Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPATO15228 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNPATO15228 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GNPATO15228 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GNPATO15228 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNPATO15228 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms